VAHTS® Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2
链特异性转录组文库构建专用试剂盒
链特异性文库：保留转录的方向性
优化的反应体系：物种类型兼容广
更宽模板兼容范围：RNA起始量可低至50 ng
简单的建库流程：一天完成文库构建及质检
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Sample |
Read_length |
Raw_reads |
Clean reads |
Q20 |
Q30 |
Adapter |
rRNA_Rate |
Expression Gene |
|
NR612-1 |
150 bp |
17812848 |
16469770 |
96.91% |
92.55% |
7.54% |
0.43% |
28733 |
|
NR612-2 |
150 bp |
17812116 |
16828594 |
97.34% |
93.33% |
5.52% |
0.44% |
29136 |
|
N |
150 bp |
17812520 |
16073548 |
96.49% |
91.75% |
9.76% |
0.44% |
28796 |
|
K |
150 bp |
17812772 |
16406916 |
96.22% |
91.48% |
7.89% |
0.56% |
28389 |
|
A |
150 bp |
20047106 |
12589976 |
96.95% |
92.89% |
37.20% |
0.34% |
26120 |
表1.以1μg的293T细胞总RNA起始，分别以VAHTS® Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2 （vazyme#NR612），N，K，A公司的链特异性mRNA试剂盒构建文库，质控后的文库用illumina Hiseq X ten PE150测序，从基本的下机数据上看A公司的文库接头残余率高达37%且基因检出数明显偏低，Vayme，N，K三个公司的在基因检出数及其他各项指标上表现较一致。
文库均一性分析
图1.以1 μg的293T细胞总RNA起始，分别以VAHTS® Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2（Vazyme#NR612），N，K，A公司的链特异性mRNA试剂盒构建文库,从图中可看出NR612，N，K，A四款RNA建库试剂盒的文库均一性都较高，没有5’或3’的偏好性。
基因组分布情况分析
图2. 将NR612，N，K，A 的下机数据比对到人参考基因组上的Reads 进行统计，从图中可看出Vazyme，N，A 比对到exon，utr，intronic，intergenic 区域的总Reads 数基本一致，K 文库比对exon 区域的数据占比偏低且比对到intronic 区的数据偏高。
VAHTS® Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina v2是针对Illumina高通量测序平台定向开发的链特异性转录组文库构建专用试剂盒。本试剂盒适用于起始模板量为0.05-4 μg完整度良好的动、植物及真菌等真核生物的总RNA的链特异转录组文库构建，与常规转录组建库不同的是在第二链合成时底物掺入了dUTP，并在PCR扩增富集文库前将带U标记的第二链模板用UDG酶消化，确保了测序信息都来自于第一链cDNA，从而保留了mRNA的链方向性，后期数据分析可确定转录本是来自DNA的正义还是反义链。
本试剂盒是VAHTS® Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina的升级产品，该版本简化了操作流程，提高了文库转化效率，兼容更低起始投入量，利用磁珠分选的方式，可以快速获得特定长度的文库，满足不同实验的个性化需求。
试剂盒包含的所有酶和缓冲液都经过了严格的质量控制和功能验证，较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。
Box1：2 ~ 8℃保存；2 ~ 8℃运输。Box2：-30 ~ -15℃保存；-20 ~ 0℃运输。
Box2：-30 ~ -15℃保存；-20 ~ 0℃运输。