Wako适合用于羟甲基化DNA分析5-hydroxymethylcytosine antibody

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适合用于羟甲基化DNA分析!5-hydroxymethylcytosine antibody

本品是对应5-hydroxymethylcytosine的单抗,能用于Hydroxymethylated DNA IP (hMeDIP)分析。

免疫动物

大鼠

类型

单克隆

交叉性

人、鼠等(适用范围广)

适用

hMeDIP、hMeDIP-seq、Dot blotting、 Immunofluorescence

背景

5-hydroxymethylcytosine是最近发现的修饰碱基,由于oxygenase的运动,从5-methylcytosine(5-mC)被转换成5-hydroxymethylcytosine(5-hmC)。

    5-hmC作为第六个碱基在生物体内有什么作用还不明朗,但是,普遍认为它与5-hmC起不同的重要作用。使用普通的硫酸氢钠法不能区别5-mC和5-hmC,所以急需找到可以特异性检测5-hmC的方法。要分别5-mC、5-hmC的序列,利用抗体反应亲和性的技术比较有效,还可以作为特异性的浓缩方法。2

1

【辨别Dual MeDIP:5-mC和5-hmC】

把基因组DNA用超声波处理,片段化到300 ~ 500 bp,用5-hydroxymethylcytosine antibody (5-hmC抗体:本品)进行羟甲基化DNA IP分析(hMeDIP)。同时对hMeDIP的非结合分层部分,用5-methylcytosine antibody(5-mC抗体)进行甲基化DNA IP分析(MeDIP)。

2

【和其他公司产品比较】

对5-hydroxymethylcytosine使用2种抗体:“Diagenode公司的单抗(本品)”和“其他公司产品的多抗”进行羟甲基化DNA IP分析(hMeDIP)。在hMeDIP里使用了Diagenode公司的hMeDIP kit。

橙字:Diagenode公司产品单抗

黑字:其他公司单抗

3

【对单链DNA和双链DNA进行羟甲基化DNA IP分析(hMeDIP)的有效性】

使用5-hydroxymethylcytosine抗体,进行hMeDIP。作为阴性对照,使用小鼠IgG。使用1μg 由hMeDIP kit(Diagenode公司)的GenDNA module制备的ES细胞(E14)的DNA,经BioruptorR进行超声波处理,片段化到300-500bp。

而经免疫沉淀得到的DNA,可使用Sfi1 (splicing factor 1) gene的引物对进行定量PCR的分析。

4

【用点印迹法时Diagenode公司的5-hmC抗体的特异性】

用5-hmC(1)和5-hmC(2)、C(3)作为各自的底物的PCR产物,经2~200ng(各自含有0.1~10pmol的C碱基)的膜进行点印迹。

在5-hmC抗体里(4μg/ml(稀释倍率1:500))孵育膜。膜暴光30秒。

数据资料

5-hydroxymethylcytosine antibody (diagenode社英語版)

产品编号

品名

包装

313-81061

5-hydroxymethylcytosine antibody

50μg

刊登的试剂只使用于试验·研究目的,不能作为“医药品”、“食品”、“家庭用品”等使用。

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