金畔生物试剂,FastSelect rRNA Kit (Human)

FastSelect rRNA Kit (Human)

锁核酸法rRNA快速去除,助力宏转录病原检测

FastSelect rRNA Kit (Human)

  • 去除人总RNA中的rRNA
  • mRNA和非编码RNA分析
  • 宏转录组检测

FastSelect rRNA Kit (Human)

  • 快速:一步去除,流程仅需2min
  • 兼容:兼容1 ng – 1 µg total RNA,兼容病原样本、FFPE样本
  • 高质:高效的rRNA去除,优异的病原检出,严格的背景菌质控

FastSelect rRNA Kit (Human)

FastSelect rRNA Kit (Human)适用于去除人总RNA中的rRNA(包括细胞质28S、18S、5.8S、5S rRNA,以及线粒体16S、12S rRNA),保留mRNA及其它非编码RNA;该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本(例如FFPE样本),得到的RNA可用于mRNA和非编码RNA(例如IncRNA)分析。该试剂盒能够快速去除人总RNA中的rRNA,操作简便快速,应用于病原微生物检出领域,能够显著提高病原检出。

 

FastSelect rRNA Kit (Human)

1. 兼容不同起始量

以293T total RNA为起始模板,投入量分别为1 ng、10 ng、100 ng、1 μg。使用Vazyme #N460以及友商同类产品对rRNA去除后进行建库。通过对高质量的Clean Reads进行分析,结果显示在不同投入量下,Vazyme #N460的rRNA残留率均少于Supplier A,且基因检出数优于Supplier A。说明Vazyme #N460的rRNA去除能力更高,基因检出数更加丰富。

FastSelect rRNA Kit (Human) FastSelect rRNA Kit (Human)

图1. 不同起始量下rRNA残留情况

图2. 不同起始量下基因检测数

 

2. 兼容病原样本

将293T、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、PEDV按500 : 1 : 1 : 10比例模拟临床病原样本,分别以1ng、100ng的模拟样本的total RNA为起始模板,分别使用Vazyme #N460以及Supplier A同类产品进行rRNA去除后,参照Vazyme #UNR605以及Supplier A同类产品进行建库。通过对病原检出进行分析,结果显示Vazyme #N460在1ng和100ng总RNA投入量下进行模拟样本病原检测,掺入的病原均有检出,且三种病原的RPM值均优于Supplier A,显著优于未去除组的病原检出。

FastSelect rRNA Kit (Human) FastSelect rRNA Kit (Human)

图1. 病原样本-1 ng投入量下的病原RPM

图2. 病原样本-100 ng投入量下的病原RPM

 

3.兼容FFPE样本

以100ng的FFPE样本的total RNA为起始模板,分别使用Vazyme #N460以及Supplier A同类产品进行rRNA去除后,参照Vazyme #UNR605以及Supplier A同类产品进行建库。通过对高质量的Clean Reads进行分析,结果显示针对FFPE样本,Vazyme #N460的rRNA残留率均少于Supplier A,且基因检出数优于Supplier A。说明Vazyme #N460对于FFPE样本的的rRNA去除能力更高,基因检出数更加丰富。 

FastSelect rRNA Kit (Human) FastSelect rRNA Kit (Human)

图1. FFPE样本的rRNA残留率

图2. FFPE样本的基因检出数

FastSelect rRNA Kit (Human)

组分

N460-01

N460-02

Fast rRNA Removal Mix

24 μl

96 μl

Nuclease-free ddH2O

1 ml

4×1 ml

FastSelect rRNA Kit (Human)

-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。

 

 

 

 

金畔生物试剂,Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

快速:操作简便,全流程只需1 h

兼容:兼容不同物种——人、小鼠、大鼠;兼容低起始量样本——低至10 ng;兼容低质量样本——如FFPE样本

高效:rRNA去除效率高,rRNA残留率<10%

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit(Human/Mouse/Rat)适用于去除人、小鼠和大鼠总RNA中的rRNA(包括细胞质28S,18S,5S rRNA以及线粒体12S,5.8S rRNA),保留mRNA及其它非编码RNA;该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本(例如FFPE样本),得到的RNA可用于mRNA和非编码RNA(例如lncRNA)分析。

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

1. 不同物种兼容性测试

以293 total RNA、Mouse total RNA、Rat total RNA为起始模板,投入量为100 ng,分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。

 

(1)rRNA残留率

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

(2)基因检出

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

结果显示:针对不同物种,Vazyme #N420的兼容性高,rRNA残留率低于10%,具有丰富的基因检出数。

 

2. 不同起始量兼容性测试

以293 total RNA为起始模板,投入量分别为1 μg、100 ng、10 ng。分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。

(1)rRNA残留率

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

 

(2)基因检出

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

结果显示:针对不同起始量样本,Vazyme #N420的兼容性高,rRNA残留率均低于5%,具有丰富的基因检出数。

 

3. FFPE样本兼容性测试

以FFPE标准品为起始模板,投入量为200 ng,分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。

 

(1)rRNA残留率

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

(2)基因检出

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

结果显示:针对FFPE样本,Vazyme #N420的兼容性高,具有丰富的基因检出数。

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

BOX 1,-30~-15℃保存,0℃运输;

BOX 2,2~8℃保存,根据不同目的地调整运输方式。